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研究动态
提取蛋白无丢失?——SCI发现RIPA提蛋白存在问题
发布时间:2017-07-31 17:01 来源:未知
       RIPA Buffer(Radio Immunoprecipitation Assay Buffer)作为一种简单高效的细胞裂解液已经被使用了几十年,在蛋白质研究领域,RIPA Buffer 已经成为了所谓的“金牌”标准,然而这个金牌真的万无一失吗?RIPA提取的蛋白会有缺陷吗?
大家都知道,RIPA 提取蛋白通常会产生两个不同的部分:即 RIPA 可溶组分和 RIPA 不可溶组分。 一般来说,只有 RIPA 可溶组分被用于下游实验,而 RIPA 不可溶组分被丢弃。但是这些被丢弃的RIPA不可溶组分中是否有蛋白成分?对于这个问题,最近有研究者对被丢弃的RIPA不可溶组分进行了分析,利用一种新的柱式快速蛋白提取法,很方便地和 RIPA 提取法做平行实验比较。
 实验方法:
分别使用柱式法和 RIPA 裂解液提取小鼠肝脏和小鼠脾脏总蛋白。
Lane1. 柱式法提取按照厂商说明进行操作,提取蛋白后无不可溶性组分产生。
Lane2. RIPA 裂解液提取,组织进行匀浆后,加裂解液摇床孵育 30 分钟后,12 000 xg 离心 10 分钟。
Lane3. RIPA 提取残留的不溶性组分使用柱式法再次进一步提取。
12% 的 SDS-PAGE 结果如下:

Figure 1. Comparison of protein profiles extracted by Minute kit and RIPA buffer. Lanes 1, 2 and 3 are proteins extracted by Minute kit, RIPA buffer and insoluble fraction of RIPA extraction respectively.
实验结果
两种方法提取的蛋白谱相似,但是不完全相同。通过 RIPA 提取后,在低分子量范围(lane 2)蛋白显著减少,而在剩余的不溶部分再次提取后(lane 3)显著增加,lane 2 和 lane 3 蛋白谱有很大差别,大量蛋白在不可溶部分丢失,蛋白质的丢失是不成比例的,并且具有选择性。
        两种不同样品丢失的蛋白谱明显不同,丢失蛋白的范围覆盖了大于 120 KD 到小于 20 KD 的蛋白。不同样品的蛋白质丢失是不可预测的。然而,离心管柱法商业试剂盒提取蛋白不产生不可溶组分,更快速,可获得更高产量更完整的蛋白质图谱。
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